一种优化的生物数据多层关联规则挖掘算法

张平 汪越胜 杨广笑 刘东 肖庆 杨曦 常俊丽 陈明洁 何光源

Background: 关联规则挖掘技术是寻找基因间关系的有效手段,但现有算法未针对高通量生物数据的特点进行优化,而存在着效率低下等缺点
Results: 提出的MAGO-FP算法,使用Gene Ontology(GO)的概念分层结构,通过对FP-Growth算法的扩展,具有一定的性能优势.在此基础上,应用该算法分析了一组由S.cerevisiae酵母菌cDNA微阵列芯片产生的实验数据,
Conclusion: 发现了一些候选关联规则.并针对其中一些重要的关联规则,通过相关文献证实了其真实性,表明该算法在基因表达分析等研究中具有应用价值.

Link:http://new.wanfangdata.com.cn/details/detail.do?_type=perio&id=swjstb200702026#

doi：10.3969/j.issn.1002-5464.2007.02.026