小麦高分子量麦谷蛋白亚基1By15N端区同源建模与分子动力学模拟
杨曦1, 黄伟伟2, 杨广笑2, 汪越胜2, 何光源2
(1.河南科技大学 医学技术与工程学院, 河南 洛阳 471003; 2.华中科技大学中英HUST-RRes基因工程和基因组学联合实验室, 湖北 武汉 430074)
摘要:通过二级结构预测、折叠识别、同源建模和分子动力学模拟的方法,获得三个小麦高分子量麦谷蛋白亚基1By15N端区的三维结构模型。模型分析发现,y-型高分子量麦谷蛋白亚基N端的5个半胱氨酸具有两种成键模式,一种是Cys22和Cys44之间形成一个链内二硫键,N端剩余的三个半胱氨酸Cys10,45和55都是自由半胱氨酸用于形成链间二硫键;另一种是Cys22和Cys44,Cys10和Cys55之间形成两对链内二硫键,剩余一个Cys45作为自由半胱氨酸用于形成链间二硫键。
关键词:小麦;麦谷蛋白;同源建模;分子动力学模拟;二硫键
Link: http://d.wanfangdata.com.cn/Periodical/lygxyxb200901017
Doi: 10.3969/j.issn.1672-6871.2009.01.017